特に重要な統計調査として、統計法の規定に基づき、総務大臣が指定した統計調査のことです。
基幹統計調査には、正確な統計を作成するため、調査票に回答する義務（報告義務）が定められています。
なお、経済構造実態調査、経済センサス‐基礎調査、経済産業省企業活動基本調査の各調査は基幹統計調査として実施します。